Биоинформатический анализ генов и полиморфизмов, вовлеченных в старение и развитие заболеваний, ассоциированных с возрастом

Целью работы было проведение биоинформатического анализа полиморфизмов генов, которые ассоциированы со старением и возраст-ассоциированными заболеваниями. Материалы и методы. Анализ генов проводился с использованием информации, полученной из базы данных полногеномных ассоциативных исследований GWAS Catalog. Для анализа белок-белковых взаимодействий (protein-protein interactions, PPI) использовалась база данных String-DB (версия 12.0). Результаты. Выявлено 7676 уникальных генов, полиморфизмы которых связаны с развитием возраст-ассоциированных заболеваний. Выявлена ассоциация молекулярных функций ряда генов (HLA-DQB1, HLA-DQA1, HLA-DRB1, FTO, APOE, APOC1 и MAPT) и их белковых продуктов со старением и возраст-ассоциированными заболеваниями.

The aim of the study was to perform a bioinformatic analysis of gene’s polymorphisms, associated with ageing and ageassociated diseases. Materials and methods. Analysis of genes was performed with the use of information, obtained from the database of genomewide association studies GWAS Catalog. String-DB database (v. 12.0) was used for analysis of protein-protein interactions (PPI). Results. 7676 unique genes have been identified, the polymorphisms of which are associated with the development of ageassociated diseases. The association of molecular functions of a number of genes (HLA-DQB1, HLA-DQA1, HLA-DRB1, FTO, APOE, APOC1 and MAPT) and their protein products with aging and age-associated diseases has been revealed.