Differences of Nonsense-Mediated mRNA Degradation Activity in Mammalian Cell Lines Revealed by a Fluorescence Reporter

Исследована активность каскада нонсенс-опосредованной деградации мРНК (nonsense-mediated mRNA decay, NMD) в нескольких культурах клеток млекопитающих. Анализ проводили с помощью недавно разработанного нами генетически кодируемого флуоресцентного сенсора [Pereverzev et al. Sci. Rep. 2015. V. 5. P. 7729]. Данный флуоресцентный NMD-репортер позволяет оценить активность NMD в единичных живых клетках по соотношению сигналов зеленого и красного флуоресцентных белков. Были проанализированы следующие клеточные линии: карцинома толстой кишки мыши CT26, карцинома легких Льюиса мыши LLC, Т-клеточный лейкоз человека Jurkat, спонтанно иммортализованная неонкогенная линия кератиноцитов человека HaCaT. Данные клеточные линии показали сильно различающуюся активность NMD. В клетках CT26 активность NMD была низкой, а в клетках LLC – высокой (в 8.5 раз выше, чем в CT26). Клетки Jurkat и HaCaT проявляли сильную гетерогенность и включали в себя две субпопуляции клеток, обладающих низкой и высокой активностью NMD. Кроме того, для первичной культуры нейронов из гиппокампа эмбрионов мыши была показана высокая активность NMD.