Отдел электронной микроскопии

Цитология
Молекулярная биология
Генетика
Заведующий лабораторией

Киреев Игорь Игоревич

д.б.н.
Публикаций
82
Цитирований
1261
Индекс Хирша
18
Публикаций
99
Цитирований
1282
Индекс Хирша
17
Публикаций
144
Цитирований
1229
Индекс Хирша
17
Необходимо авторизоваться.

Центр коллективного пользования в области биологической оптической и электронной микроскопии, с личным интересом в структурно-функциональной организации генома эукариот

  1. Просвечивающая микроскопия высокого разрешения
  2. Конфокальная микроскопия
  3. Субдифракционная микроскопия

Микроскоп с суперразрешением Nikon N-SIM/N-STORM представляет собой комбинацию двух технологий микроскопии сверхвысокого разрешения, SIM и STORM, на одной станине. Микроскопия сверхвысокого разрешения позволяет преодолевать дифракционный барьер и добиваться недоступного для классической флуоресцентной микроскопии разрешения в том числе при прижизненной съемке.

Просвечивающий электронный микроскоп JEM-1400 (JEOL, Япония) оптимизирован для получения высококонтрастных высокоразрешающих изображений, в первую очередь на медико-биологических образцах.

Лазерный конфокальный сканирующий микроскоп Nikon C2, комбинирующий функцию широкополого флоресцентного и конфокального микроскопа на одной станине.

Игорь Киреев
Заведующий лабораторией
Голышев Сергей Александрович
Сергей Голышев
Старший научный сотрудник
Жиронкина Оксана Андреевна
Оксана Жиронкина
Старший научный сотрудник
Овсянникова Наталья Леонидовна
Наталья Овсянникова
Младший научный сотрудник

Направления исследований

Ядерная ламина в норме и патологии

+
Ядерная ламина в норме и патологии
Основная функция белков ядерной оболочки - ламинов (белки, принадлежащие V классу промежуточных филаментов), состоит в поддержании целостность ядра. Мутации в различных участках гена LMNA приводят к развитию разных заболеваний, включая липодистрофии, мышечные дистрофии и синдромы ускоренного старения, среди которых наиболее известна прогерия Хатчинсона-Джилфорда (HGPS), редкое заболевание (один случай на 8 000000), чаще всего ассоциированное с мутацией 1824C>T, приводящей к накоплению незрелой формы ламина А - прогерина. Одним из возможных механизмов развития прогероидных синдромов при мутации в гене LMNA является нарушение эпигенетической регуляции, осуществляемой при участии ядерной ламины и реализуемой как на уровне контроля пост-трансляционных модификаций гистонов, так и на уровне структурной организации хроматина, в том числе 3D-позиционирования генных локусов. Настоящий проект нацелен на исследование эпигенетических аспектов развития прогероидных синдромов на моделях дифференцирующихся in vitro индуцированных стволовых клеток, полученных от пациентов с HGPS, с акцентом на нарушения локальной и глобальной организации хроматина

SMC-комплексы в регуляции репликации и сегрегации генома

+
SMC-комплексы в регуляции репликации и сегрегации генома
Точная передача генетической информации в ходе митоза требует высокой степени компактизации генетического материала. У высших эукариот процесс компактизации осуществляется за счет сложной многоуровневой укладки хроматина с участием нескольких типов архитектурных хромосомных белков, включая комплексы на основе SMC-белков (когезин и конденсин). Способ упаковки хроматина, а следовательно и особенности его динамики и характер взаимодействия с архитектурными белками, могут отличаться в различных функциональных доменах хромосом, однако данные аспекты пространственной организации хромосом недостаточно исследованы. Современный прогресс в этой области, связанный с развитием технологий высокопроизводительного секвенирования и молекулярных методов анализа конформации хроматина (3С и его модификации), позволил косвенными методами подтвердить высказывавшиеся ранее гипотезы о существовании топологически изолированных хроматиновых доменов, однако для создания полной картины характера пространственной организации генома эукариот на различных уровнях упаковки требует более полной интеграции молекулярных и структурных данных. В этой связи особенно важно сопоставление структурной информации об упаковке ДНК с составе известных генных локусов с данными анализа межмолекулярных контактов в них. К сожалению, современные подходы для исследования структурной организации хроматина либо не обладают достаточным уровнем пространственного разрешения, либо нарушают структуру хроматина, что требует разработки новых методов. Нарушение функции архитектурных белков хромосом, например, в результате мутаций, ассоциированных с синдромом Корнелии де Ланге, приводит в первую очередь к генетической нестабильности из-за дефектов процесса сегрегации генетического материала, а также нарушения компактизации хроматина. Предлагаемый проект нацелен на исследование структурной организации хроматиновых доменов высшего порядка и выяснение роли комплексов когезина в их формировании. Особое внимание будет уделено изучению локальной динамики различных структурно-функциональных доменов хромосом в клеточном цикле, включая перестройки хроматина для репликации и митотической компактизации, а также при изменении транскрипционного статуса на фоне мутаций когезина, на клеточных моделях, рекапитулирующих фенотип синдрома Корнелии де Ланге.

Публикации и патенты

Lamin A as a Determinant of Mechanical Properties of the Cell Nucleus in Health and Disease
Ovsiannikova N.L., Lavrushkina S.V., Ivanova A.V., Mazina L.M., Zhironkina O.A., Kireev I.I.
Biochemistry. Biokhimiia 2021 цитирований: 0
RNA Aptamers for Theranostics of Glioblastoma of Human Brain
Kopylov A.M., Fab L.V., Antipova O., Savchenko E.A., Revishchin A.V., Parshina V.V., Pavlova S.V., Kireev I.I., Golovin A.V., Usachev D.Y., Pavlova G.V.
Q2 Biochemistry (Moscow) 2021 цитирований: 0
Treacle and TOPBP1 control replication stress response in the nucleolus
Velichko A.K., Ovsyannikova N., Petrova N.V., Luzhin A.V., Vorobjeva M., Gavrikov A.S., Mishin A.S., Kireev I.I., Razin S.V., Kantidze O.L.
Q1 Journal of Cell Biology 2021 цитирований: 6
Suppression of liquid-liquid phase separation by 1,6-hexanediol partially compromises the 3D genome organization in living cells
Ulianov S.V., Velichko A., Magnitov M.D., Luzhin A., Golov A.K., Ovsyannikova N., Kireev I.I., Gavrikov A., Mishin A., Garaev A.K., Tyakht A.V., Gavrilov A., Kantidze O.L., Razin S.V.
Q1 Nucleic Acids Research 2021 цитирований: 21
Open Access
Open access
Mapping mechanical properties of living cells at nanoscale using intrinsic nanopipette-sample force interactions
Kolmogorov V.S., Erofeev A.S., Woodcock E., Efremov Y.M., Iakovlev A.P., Savin N.A., Alova A.V., Lavrushkina S.V., Kireev I.I., Prelovskaya A.O., Sviderskaya E.V., Scaini D., Klyachko N.L., Timashev P.S., Takahashi Y., et. al.
Q1 Nanoscale 2021 цитирований: 11
Studying the Local Young's Modulus of PC-3 Cells Via Scanning Ion-Conductance Microscopy
Kolmogorov V., Vaneev A., Efremov Y.M., Savin N., Iakovlev A., Alova A., Lavrushkina S., Erofeev A., Gorelkin P., Klyachko N., Kireev I., Majouga A., Novak P., Korchev Y.E.
Q1 Biophysical Journal 2021 цитирований: 1
Osteoclasts differentiation from murine RAW 264.7 cells stimulated by RANKL: Timing and behavior
Lampiasi N., Russo R., Kireev I., Strelkova O., Zhironkina O., Zito F.
Q1 Biology 2021 цитирований: 8
Open Access
Open access
Propagation of Mitochondria-Derived Reactive Oxygen Species within the Dipodascus magnusii Cells
Rogov A.G., Goleva T.N., Epremyan K.K., Kireev I.I., Zvyagilskaya R.A.
Q1 Antioxidants 2021 цитирований: 6
Open Access
Open access
Impaired expression of cytoplasmic actins leads to chromosomal instability of mda-mb-231 basal-like mammary gland cancer cell line
Dugina V., Shagieva G., Novikova M., Lavrushkina S., Sokova O., Kireev I., Kopnin P.
Q1 Molecules 2021 цитирований: 1
Open Access
Open access
Inhibition of FGF2-Mediated Signaling in GIST—Promising Approach for Overcoming Resistance to Imatinib
Boichuk S., Galembikova A., Mikheeva E., Bikinieva F., Aukhadieva A., Dunaev P., Khalikov D., Petrov S., Kurtasanov R., Valeeva E., Kireev I., Dugina V., Lushnikova A., Novikova M., Kopnin P.
Q1 Cancers 2020 цитирований: 6
Open Access
Open access
Chromatin Trapping of Factors Involved in DNA Replication and Repair Underlies Heat-Induced Radio- and Chemosensitization
Luzhin A.V., Avanesyan B., Velichko A.K., Shender V.O., Ovsyannikova N., Arapidi G.P., Shnaider P.V., Petrova N.V., Kireev I.I., Razin S.V., Kantidze O.L.
Q1 Cells 2020 цитирований: 1
Open Access
Open access
Labyrinthula diatomea n. sp.—A Labyrinthulid Associated with Marine Diatoms
Popova O.V., Belevich T.A., Golyshev S.A., Kireev I.I., Aleoshin V.V.
Q2 Journal of Eukaryotic Microbiology 2020 цитирований: 3
Interaction of two strongly divergent archaellins stabilizes the structure of theHalorubrumarchaellum
Pyatibratov M.G., Syutkin A.S., Quax T.E., Melnik T.N., Papke R.T., Gogarten J.P., Kireev I.I., Surin A.K., Beznosov S.N., Galeva A.V., Fedorov O.V.
Q3 MicrobiologyOpen 2020 цитирований: 5
Open Access
Open access
Magnetic liposome design for drug release systems responsive to super-low frequency alternating current magnetic field (AC MF)
Vlasova K.Y., Piroyan A., Le-Deygen I.M., Vishwasrao H.M., Ramsey J.D., Klyachko N.L., Golovin Y.I., Rudakovskaya P.G., Kireev I.I., Kabanov A.V., Sokolsky-Papkov M.
Q1 Journal of Colloid and Interface Science 2019 цитирований: 27
Open Access
Open access
Evolution of platelet function in adult patients with chronic immune thrombocytopenia on romiplostim treatment
Ignatova A.A., Demina I.A., Ptushkin V.V., Khaspekova S.G., Shustova O.N., Pankrashkina M.M., Ryabykh A.A., Obydennyi S.I., Strelkova O.S., Polokhov D.M., Seregina E.A., Poletaev A.V., Ataullakhanov F.I., Kireev I.I., Mazurov A.V., et. al.
Q1 British Journal of Haematology 2019 цитирований: 6
Open Access
Open access

Партнёры

Адрес лаборатории

119234, г. Москва, микрорайон Ленинские Горы, дом 1, стр. 40
Необходимо авторизоваться.