Отдел электронной микроскопии

Число
публикаций
Общее число
цитирований
Индекс
Хирша
92
1020
17
137
1006
16
70
923
15
Необходимо авторизоваться.

Организация

НИИ физико-химической биологии имени А. Н. Белозерского МГУ

Области науки

  • Цитология
  • Молекулярная биология
  • Генетика

Чем мы занимаемся?

Центр коллективного пользования в области биологической оптической и электронной микроскопии, с личным интересом в структурно-функциональной организации генома эукариот

Используемые методы

  • Просвечивающая микроскопия высокого разрешения
  • Конфокальная микроскопия
  • Субдифракционная микроскопия
Игорь Киреев

Заведующий лабораторией

Сергей Голышев

Старший научный сотрудник

Оксана Жиронкина

Старший научный сотрудник

Наталья Овсянникова

Младший научный сотрудник

Направления исследований

Ядерная ламина в норме и патологии

+
Ядерная ламина в норме и патологии

Основная функция белков ядерной оболочки - ламинов (белки, принадлежащие V классу промежуточных филаментов), состоит в поддержании целостность ядра. Мутации в различных участках гена LMNA приводят к развитию разных заболеваний, включая липодистрофии, мышечные дистрофии и синдромы ускоренного старения, среди которых наиболее известна прогерия Хатчинсона-Джилфорда (HGPS), редкое заболевание (один случай на 8 000000), чаще всего ассоциированное с мутацией 1824C>T, приводящей к накоплению незрелой формы ламина А - прогерина. Одним из возможных механизмов развития прогероидных синдромов при мутации в гене LMNA является нарушение эпигенетической регуляции, осуществляемой при участии ядерной ламины и реализуемой как на уровне контроля пост-трансляционных модификаций гистонов, так и на уровне структурной организации хроматина, в том числе 3D-позиционирования генных локусов. Настоящий проект нацелен на исследование эпигенетических аспектов развития прогероидных синдромов на моделях дифференцирующихся in vitro индуцированных стволовых клеток, полученных от пациентов с HGPS, с акцентом на нарушения локальной и глобальной организации хроматина

SMC-комплексы в регуляции репликации и сегрегации генома

+
SMC-комплексы в регуляции репликации и сегрегации генома

Точная передача генетической информации в ходе митоза требует высокой степени компактизации генетического материала. У высших эукариот процесс компактизации осуществляется за счет сложной многоуровневой укладки хроматина с участием нескольких типов архитектурных хромосомных белков, включая комплексы на основе SMC-белков (когезин и конденсин). Способ упаковки хроматина, а следовательно и особенности его динамики и характер взаимодействия с архитектурными белками, могут отличаться в различных функциональных доменах хромосом, однако данные аспекты пространственной организации хромосом недостаточно исследованы. Современный прогресс в этой области, связанный с развитием технологий высокопроизводительного секвенирования и молекулярных методов анализа конформации хроматина (3С и его модификации), позволил косвенными методами подтвердить высказывавшиеся ранее гипотезы о существовании топологически изолированных хроматиновых доменов, однако для создания полной картины характера пространственной организации генома эукариот на различных уровнях упаковки требует более полной интеграции молекулярных и структурных данных. В этой связи особенно важно сопоставление структурной информации об упаковке ДНК с составе известных генных локусов с данными анализа межмолекулярных контактов в них. К сожалению, современные подходы для исследования структурной организации хроматина либо не обладают достаточным уровнем пространственного разрешения, либо нарушают структуру хроматина, что требует разработки новых методов. Нарушение функции архитектурных белков хромосом, например, в результате мутаций, ассоциированных с синдромом Корнелии де Ланге, приводит в первую очередь к генетической нестабильности из-за дефектов процесса сегрегации генетического материала, а также нарушения компактизации хроматина. Предлагаемый проект нацелен на исследование структурной организации хроматиновых доменов высшего порядка и выяснение роли комплексов когезина в их формировании. Особое внимание будет уделено изучению локальной динамики различных структурно-функциональных доменов хромосом в клеточном цикле, включая перестройки хроматина для репликации и митотической компактизации, а также при изменении транскрипционного статуса на фоне мутаций когезина, на клеточных моделях, рекапитулирующих фенотип синдрома Корнелии де Ланге.

Публикации и патенты

Q3
RNA Aptamers for Theranostics of Glioblastoma of Human Brain
Kopylov A.M., Fab L.V., Antipova O., Savchenko E.A., Revishchin A.V., Parshina V.V., Pavlova S.V., Kireev I.I., Golovin A.V., Usachev D.Y., Pavlova G.V.
Biochemistry (Moscow), 2021, цитирований: 0
Q1
Treacle and TOPBP1 control replication stress response in the nucleolus
Velichko A.K., Ovsyannikova N., Petrova N.V., Luzhin A.V., Vorobjeva M., Gavrikov A.S., Mishin A.S., Kireev I.I., Razin S.V., Kantidze O.L.
Journal of Cell Biology, 2021, цитирований: 2
Q1
Mapping mechanical properties of living cells at nanoscale using intrinsic nanopipette-sample force interactions
Kolmogorov V.S., Erofeev A.S., Woodcock E., Efremov Y.M., Iakovlev A.P., Savin N.A., Alova A.V., Lavrushkina S.V., Kireev I.I., Prelovskaya A.O., Sviderskaya E.V., Scaini D., Klyachko N.L., Timashev P.S., Takahashi Y., et. al.
Nanoscale, 2021, цитирований: 1
Q1
Osteoclasts differentiation from murine RAW 264.7 cells stimulated by RANKL: Timing and behavior
Lampiasi N., Russo R., Kireev I., Strelkova O., Zhironkina O., Zito F.
Biology, 2021, цитирований: 1
Q3
Propagation of Mitochondria-Derived Reactive Oxygen Species within the Dipodascus magnusii Cells
Rogov A.G., Goleva T.N., Epremyan K.K., Kireev I.I., Zvyagilskaya R.A.
Antioxidants, 2021, цитирований: 1
Q2
Impaired expression of cytoplasmic actins leads to chromosomal instability of mda-mb-231 basal-like mammary gland cancer cell line
Dugina V., Shagieva G., Novikova M., Lavrushkina S., Sokova O., Kireev I., Kopnin P.
Molecules, 2021, цитирований: 0
Q3
Inhibition of FGF2-Mediated Signaling in GIST—Promising Approach for Overcoming Resistance to Imatinib
Boichuk S., Galembikova A., Mikheeva E., Bikinieva F., Aukhadieva A., Dunaev P., Khalikov D., Petrov S., Kurtasanov R., Valeeva E., Kireev I., Dugina V., Lushnikova A., Novikova M., Kopnin P.
Cancers, 2020, цитирований: 2
Q2
Chromatin Trapping of Factors Involved in DNA Replication and Repair Underlies Heat-Induced Radio- and Chemosensitization
Luzhin A.V., Avanesyan B., Velichko A.K., Shender V.O., Ovsyannikova N., Arapidi G.P., Shnaider P.V., Petrova N.V., Kireev I.I., Razin S.V., Kantidze O.L.
Cells, 2020, цитирований: 0
Q2
Labyrinthula diatomea n. sp.—A Labyrinthulid Associated with Marine Diatoms
Popova O.V., Belevich T.A., Golyshev S.A., Kireev I.I., Aleoshin V.V.
Journal of Eukaryotic Microbiology, 2020, цитирований: 2
Q3
Interaction of two strongly divergent archaellins stabilizes the structure of theHalorubrumarchaellum
Pyatibratov M.G., Syutkin A.S., Quax T.E., Melnik T.N., Papke R.T., Gogarten J.P., Kireev I.I., Surin A.K., Beznosov S.N., Galeva A.V., Fedorov O.V.
MicrobiologyOpen, 2020, цитирований: 3
Q1
Magnetic liposome design for drug release systems responsive to super-low frequency alternating current magnetic field (AC MF)
Vlasova K.Y., Piroyan A., Le-Deygen I.M., Vishwasrao H.M., Ramsey J.D., Klyachko N.L., Golovin Y.I., Rudakovskaya P.G., Kireev I.I., Kabanov A.V., Sokolsky-Papkov M.
Journal of Colloid and Interface Science, 2019, цитирований: 17
Q1
Evolution of platelet function in adult patients with chronic immune thrombocytopenia on romiplostim treatment
Ignatova A.A., Demina I.A., Ptushkin V.V., Khaspekova S.G., Shustova O.N., Pankrashkina M.M., Ryabykh A.A., Obydennyi S.I., Strelkova O.S., Polokhov D.M., Seregina E.A., Poletaev A.V., Ataullakhanov F.I., Kireev I.I., Mazurov A.V., et. al.
British Journal of Haematology, 2019, цитирований: 5
Q1
Hypoosmotic stress induces R loop formation in nucleoli and ATR/ATM-dependent silencing of nucleolar transcription
Velichko A.K., Petrova N.V., Luzhin A.V., Strelkova O.S., Ovsyannikova N., Kireev I.I., Petrova N.V., Razin S.V., Kantidze O.L.
Nucleic Acids Research, 2019, цитирований: 13
Q1
Mechanisms of increased mitochondria-dependent necrosis in Wiskott-Aldrich syndrome platelets
Obydennyi S.I., Artemenko E.O., Sveshnikova A.N., Ignatova A.A., Varlamova T.V., Gambaryan S., Lomakina G.Y., Ugarova N.N., Kireev I.I., Ataullakhanov F.I., Novichkova G.A., Maschan A.A., Shcherbina A., Panteleev M.
Haematologica, 2019, цитирований: 12
Q3
Mitochondrial Damage and Mitochondria-Targeted Antioxidant Protection in LPS-Induced Acute Kidney Injury
Plotnikov E., Pevzner I., Zorova L., Chernikov V., Prusov A., Kireev I., Silachev D., Skulachev V., Zorov D.
Antioxidants, 2019, цитирований: 20

Партнёры

Местонахождение лаборатории

Москва, Ленинские горы, д. 1, стр. 40

Необходимо авторизоваться.