Лаборатория системной геномики и мобиломики растений
Киров Илья Владимирович
Наша лаборатория была организована в 2022 году и объединила молодых учёных, увлечённых изучением мобильных элементов генома растений. Мобильные элементы являются важнейшими естественными драйверами эволюции и селекции растений. Последние исследования показали, что благодаря редкой активности мобильных элементов появились многие полезные признаки сельскохозяйственных растений. Используя современные методы биоинформатики, молекулярной биологии, геномного редактирования и нанопорового секвенирования, мы исследуем мобильные элементы в геномах сельскохозяйственных (томат, подсолнечник, соя, рапс) и модельных (арабидопсис и табак) растений. Конечная цель наших исследований это глубже понять биологию мобильных элементов, их жизненный цикл и использовать эти знания для разработки новых биотехнологических методов для ускоренного создания новых генотипов растений. В 2023 году мы ввели новый термин, биологический мутагенез (Kirov, IJMS, 2023). Биологический мутагенез - это процесс получения мутаций в геноме, используя биологические агенты, включая мобильные элементы, вирусы, РНК и белки. В настоящее время мы разрабатываем платформу для биологического мутагенеза сельскохозяйственных растений через контролируемую и временную активацию мобильных элементов. Это позволит привносить новые признаки в существующие сорта растений, а также получать новые культурные растения с необычной морфологией и вкусовыми характеристиками.
- Нанопоровое секвенирование
- Таргетное секвенирование
- Кольцевые ДНК
- SIRT
- Mobilome-Seq
- Полногеномное и транскриптомное секвенирование
- Аннотация мобильных элементов и других повторяющихся элементов
Направления исследований
Разработка методов биологического мутагенеза растений