29 June 2023, 22:00 Анна Солдатенко

Многоуровневый анализ показал взаимосвязи микробиома с другими «омами» при РАС

Многоуровневый анализ показал взаимосвязи микробиома с другими «омами» при РАС
Source: Caleb Woods / Unsplash

Расстройство аутистического спектра (РАС) включает в себя широкий спектр нарушений развития нервной системы, которые объединены трудностями в общении с окружающими, ограниченностью интересов и повторяющимися действиями. Что служит его причиной, до сих пор до конца не ясно, тем более что у разных людей проявление отличается.

Идентифицировано более сотни генов, вероятно, ассоциированных с РАС; ряд из них уже считается диагностическими признаками, связанными с конкретными состояниями, тогда как другие до сих пор не удалось связать с конкретными симптомами. Однако генетика — не единственный фактор развития РАС. Большое значение имеет среда, в которой взрослеет человек, а также его индивидуальные особенности — они определят и проявление болезни.

Так, пациенты с расстройством имеют повышенные риски возникновения проблем с желудочно-кишечным трактом (запоры, диарея и прочие). Поскольку уже доказано влияние микроорганизмов, населяющих кишечник, на работу нервной системы, они же могут быть одним из факторов развития РАС. Действительно, обнаружены различия микробиома у аутистичных и нейротипичных детей, однако данные достаточно противоречивы. К тому же не совсем понятно, как именно они связаны с другими факторами; имеет значение постановка эксперимента и то, как обрабатываются результаты.

Международный коллектив, в который вошли и российские исследователи, разработал алгоритм байесовского дифференциального ранжирования, способный идентифицировать специфичные для РАС профили по тому или иному признаку. Авторы анализировали набор данных о микробиоме, а также о питании, метаболитах (конечных продуктах обмена веществ), цитокинах, важных для работы иммунитета, и активности генов человеческого мозга, взятые из открытых источников.

Прежде всего, подход позволил четко различить по микробиому детей с РАС и неродственных им нейротипичных детей соответствующего возраста и пола, что подтвердилось сразу несколькими методиками. Параллельный анализ информации об уровнях цитокинов, наборе молекул РНК, синтезируемых клетками, и результатов опросника о питании показал сильную связь между этими факторами у людей с РАС. Было обнаружено и весьма специфическое соответствие между метаболическими особенностями микробиома и активностью ряда генов в мозге. Так, 95 метаболических путей, сильно выраженных в тканях мозга людей с РАС, имели аналоги и у микробов кишечника. Сравнение результатов анализа для микробиома и опросника про диету выявило снижение потребления аминокислот и углеводов, связанное со специфическими профилями микробиома у детей с РАС. Метаболические и диетические дисбалансы, особенно в отношении уровней глутамата (один из нейромедиаторов), были также очевидны, хотя и слабо, в метаболомах сыворотки, кала и мочи. Авторы выделили и конкретные микроорганизмы, вероятно, тесно связанные с РАС, и показали их взаимодействие с другими факторами. Например, анализ показал сильную связь между наличием в микробиоме Prevotella copri и малым количеством углеводов в диете в дополнение к росту уровня провоспалительного цитокина ИЛ-6.

Выводы исследователей пока не позволяют составить стройную и однозначную функциональную структуру РАС — то есть до момента, когда будут описаны все пути, задействованные в развитии болезни, пройдет еще много времени. Однако уже сейчас работа дает основу для ее построения. Это важно для лучшей диагностики аутизма у детей и подбора таргетных подходов к улучшению их состояния.

News article publications

Read also

Новый подход в нейрохирургии упростит мониторинг кровотока
Ученые создали и протестировали технологию для контроля кровотока в режиме реального времени во время операций на головном мозге. В отличие от существующих аналогов, эта система не требует введения контрастных веществ в кровь и использования дорогостоящих материалов. Это поможет нейрохирургам точнее отслеживать показатели кровотока мозга пациента, тем самым повышая безопасность операции и предотвращая возможные осложнения: кровоизлияния и образование тромбов.
Medicine
Neuroscience
Surgery
26 March 2024
Желтый свет с длиной волны 565 нанометров обезвредит «спящие» очаги туберкулеза
Ученые предложили избавляться от лекарственно-устойчивых и «спящих» форм микобактерий — возбудителей туберкулеза — с помощью желтого света. Неактивные патогены нечувствительны ко всем известным антибиотикам, а потому часто остаются в легких пациентов даже после лечения и вызывают рецидивы заболевания. Эксперименты продемонстрировали, что новый подход позволяет уничтожить 99,99% бактерий всего за 30 минут облучения светом с длиной волны 565 нанометров.
Infectious diseases
Medical Physics
Medicine
19 March 2024
Обновлена база моделей характерных последовательностей в ДНК
Международная группа ученых сделала большое обновление HOCOMOCO — базы моделей нуклеотидных последовательностей участков ДНК, связывающих транскрипционные факторы, созданной в 2013 году.
Computer science
Data analysis
Genetics
19 February 2024
Найдены антибиотики для безопасного лечения бактериальных инфекций у младенцев
Ученые доказали, что не все антибиотики, используемые для лечения тяжелых бактериальных инфекций у младенцев, вредят работе почек. Оказалось, что есть комбинации препаратов, которые, наоборот, улучшают состояние этих органов при болезни. Полученные данные помогут врачам подбирать безопасное лечение для новорожденных, которое не приведет к серьезным побочным эффектам.
Bacteriology
Medicine
Pediatrics
15 February 2024
Инновационная молекула станет основой антидепрессанта нового поколения
Клиническая депрессия, или большое депрессивное расстройство — это не просто модное название для подавленного настроения, а комплекс тяжелых симптомов. Пациенты с таким диагнозом не способны испытывать радость, страдают от чувства вины, слабости, апатии и усталости, у них ухудшаются когнитивные функции и память, возникают проблемы со сном и аппетитом. Подобное состояние может длиться месяцами, а в тяжелых случаях – годами, из-за чего человек может потерять работу и думать о суициде. Справиться с ним практически невозможно без правильной медицинской помощи — комбинации лекарств и психотерапии. Российские ученые из ФИЦ «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН испытали на грызунах новый потенциальный антидепрессант.
Biomedicine
Drug Design
Medicine
Pharmacology
10 February 2024
Предложен новый способ безыгольных инъекций
Ученые Центра фотоники и двумерных материалов МФТИ с коллегами представили инновационный способ безыгольных инъекций. Проведенные исследования показали эффективность предложенной схемы и возможность к широкому применению.
Medicine
Microbiology
Nanomedicine
9 February 2024