Лаборатория химии нуклеиновых кислот, кафедра Химии природных соединений, Химический факультет
Заведующий
Готтих Марина Борисовна
Публикаций
100
Цитирований
1 127
Индекс Хирша
18
Необходимо авторизоваться.
GottikhLab объединяет сотрудников и студентов различных подразделений МГУ им. М.В. Ломоносова, которые изучают особенности репликации вирусов, взаимодействие вирусных и клеточных белков, а также пытаются трансформировать эти знания в новые подходы к контролю вирусных инфекций. Основные объекты: ВИЧ-1 и SARS-CoV-2.
- Дизайн и валидация siРНК
- Вестерн-блот
- Гель-электрофорез
- ПЦР
- Сайт-направленный мутагенез
- Оценка эффективности репарации ДНК по NHEJ-пути с использованием репортерных векторов, метод ДНК-комет (Comet assay)
- Работа с клетками эукариот: CRISPR-Cas9 молификация клеток, получение стабильно-трансдуцированных клеточных линий, нокдаун, суперэкспрессия, функциональные тесты
- Работа с белок-белковыми и ДНК-белковыми комплексами, в том числе оценка аффинности, идентификация сайтов взаимодействия между белками, определение сайта связывания белка на ДНК
- ПЦР в реальном времени и цифровая ПЦР, включая дизайн и валидацию праймеров и зондов к Вашей мишени
- Модификация и сборка лентивирусных векторов
- Наработка и выделение рекомбинантных белков из E.coli или клеток насекомых (с использованием бакуловирусных векторов) методами аффинной хроматографии
- Получение бактериальных и эукариотических векторов с использованием генно-инженерных подходов
Марина Готтих
Заведующий
Сергей Королев
Ведущий научный сотрудник
Татьяна Приказчикова
Старший научный сотрудник
Юлия Агапкина
Старший научный сотрудник
Андрей Анисенко
Доцент
Всего публикаций
100
Всего цитирований
1127
Цитирований на публикацию
11.27
Среднее число публикаций в год
2.63
Годы публикаций
1987-2024 (38 лет)
h-index
18
i10-index
32
m-index
0.47
o-index
46
g-index
28
w-index
3
Описание метрик
h-index
Учёный имеет индекс h, если h из его N статей цитируются как минимум h раз каждая, в то время как оставшиеся (N - h) статей цитируются не более чем h раз каждая.
i10-index
Число статей автора, получивших не менее 10 ссылок каждая.
m-index
m-индекс ученого численно равен отношению его h-индекса к количеству лет, прошедших с момента первой публикации.
o-index
Среднее геометрическое h-индекса и числа цитирований наиболее цитируемой статьи ученого.
g-index
Для данного множества статей, отсортированного в порядке убывания количества цитирований, которые получили эти статьи, g-индекс это наибольшее число, такое что g самых цитируемых статей получили (суммарно) не менее g2 цитирований.
w-index
Если w статей ученого имеют не менее 10w цитирований каждая и другие статьи меньше, чем 10(w+1) цитирований, то w-индекс исследователя равен w.
Топ-100
Области наук
Журналы
Цитирующие журналы
Цитируемые журналы
Издатели
|
5
10
15
20
25
|
|
|
Pleiades Publishing
23 публикации, 23%
|
|
|
Elsevier
17 публикаций, 17%
|
|
|
Taylor & Francis
13 публикаций, 13%
|
|
|
Springer Nature
8 публикаций, 8%
|
|
|
MDPI
8 публикаций, 8%
|
|
|
Wiley
7 публикаций, 7%
|
|
|
American Chemical Society (ACS)
4 публикации, 4%
|
|
|
The Russian Academy of Sciences
4 публикации, 4%
|
|
|
Acta Naturae Ltd
4 публикации, 4%
|
|
|
Oxford University Press
2 публикации, 2%
|
|
|
American Society for Biochemistry and Molecular Biology
2 публикации, 2%
|
|
|
Royal Society of Chemistry (RSC)
1 публикация, 1%
|
|
|
American Society for Microbiology
1 публикация, 1%
|
|
|
Mary Ann Liebert
1 публикация, 1%
|
|
|
Public Library of Science (PLoS)
1 публикация, 1%
|
|
|
Hindawi Limited
1 публикация, 1%
|
|
|
Institute of Biochemistry
1 публикация, 1%
|
|
|
European Molecular Biology Organization
1 публикация, 1%
|
|
|
Autonomous Non-profit Organization Editorial Board of the journal Uspekhi Khimii
1 публикация, 1%
|
|
|
5
10
15
20
25
|
Организации из публикаций
|
10
20
30
40
50
60
70
80
|
|
|
Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
77 публикаций, 77%
|
|
|
Организация не определена
|
Организация не определена, 19, 19%
Организация не определена
19 публикаций, 19%
|
|
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
16 публикаций, 16%
|
|
|
Институт Гюстава Русси
13 публикаций, 13%
|
|
|
Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
4 публикации, 4%
|
|
|
Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН
4 публикации, 4%
|
|
|
Сколковский институт науки и технологий
4 публикации, 4%
|
|
Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н. Н. Блохина Минздрава России
4 публикации, 4%
|
|
|
Каролинский институт
4 публикации, 4%
|
|
|
Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН
3 публикации, 3%
|
|
|
ФИЦ «Фундаментальные Основы Биотехнологии» РАН
3 публикации, 3%
|
|
|
Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени Н. Ф. Гамалеи
3 публикации, 3%
|
|
|
Подразделение Институт вирусологии им. Д. И. Ивановского «НИЦЭМ им. Н. Ф. Гамалеи» Минздрава России
3 публикации, 3%
|
|
|
Федеральный исследовательский центр проблем химической физики и медицинской химии РАН
3 публикации, 3%
|
|
|
Институт биологии гена РАН
2 публикации, 2%
|
|
|
Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт"
2 публикации, 2%
|
|
|
Российский химико-технологический университет имени Д. И. Менделеева
2 публикации, 2%
|
|
|
Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины имени академика Ю.М. Лопухина ФМБА
2 публикации, 2%
|
|
|
ГНЦ "Институт иммунологии" ФМБА России
2 публикации, 2%
|
|
|
Центральный НИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора
2 публикации, 2%
|
|
|
ПАО Сбербанк
2 публикации, 2%
|
|
|
Страсбургский университет
2 публикации, 2%
|
|
|
Университет восточной Финляндии
2 публикации, 2%
|
|
|
Франкфуртский университет имени Иоганна Вольфганга Гёте
2 публикации, 2%
|
|
|
Парижская обсерватория
2 публикации, 2%
|
|
|
Медицинская школа имени Чана при Массачусетском университете
2 публикации, 2%
|
|
|
Институт элементоорганических соединений им. А.Н. Несмеянова РАН
1 публикация, 1%
|
|
|
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН
1 публикация, 1%
|
|
|
Институт молекулярной генетики
1 публикация, 1%
|
|
|
Первый Московский государственный медицинский университет имени И. М. Сеченова
1 публикация, 1%
|
|
|
Институт биохимии имени А. Н. Баха РАН
1 публикация, 1%
|
|
|
Волгоградский государственный медицинский университет
1 публикация, 1%
|
|
|
Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н. И. Пирогова
1 публикация, 1%
|
|
|
Научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов
1 публикация, 1%
|
|
|
Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М. П. Чумакова РАН
1 публикация, 1%
|
|
|
Лундский университет
1 публикация, 1%
|
|
|
Стокгольмский университет
1 публикация, 1%
|
|
|
Урбинский университет Карло Бо
1 публикация, 1%
|
|
|
Абердинский университет
1 публикация, 1%
|
|
|
Университет имени Лоранда Этвёша (Будапештский университет)
1 публикация, 1%
|
|
|
Университет Париж-Сите
1 публикация, 1%
|
|
|
Мичиганский университет
1 публикация, 1%
|
|
|
Рурский университет
1 публикация, 1%
|
|
|
Медицинский центр Амстердамского университета
1 публикация, 1%
|
|
|
Амстердамский университет
1 публикация, 1%
|
|
|
Медицинское отделение Техасского университета
1 публикация, 1%
|
|
|
Университет Суррея
1 публикация, 1%
|
|
|
Рижский университет имени Страдыня
1 публикация, 1%
|
|
|
10
20
30
40
50
60
70
80
|
|
Страны из публикаций
|
10
20
30
40
50
60
70
80
|
|
|
Россия
|
Россия, 77, 77%
Россия
77 публикаций, 77%
|
|
Страна не определена
|
Страна не определена, 26, 26%
Страна не определена
26 публикаций, 26%
|
|
Франция
|
Франция, 24, 24%
Франция
24 публикации, 24%
|
|
США
|
США, 4, 4%
США
4 публикации, 4%
|
|
Швеция
|
Швеция, 4, 4%
Швеция
4 публикации, 4%
|
|
Германия
|
Германия, 3, 3%
Германия
3 публикации, 3%
|
|
Великобритания
|
Великобритания, 2, 2%
Великобритания
2 публикации, 2%
|
|
Финляндия
|
Финляндия, 2, 2%
Финляндия
2 публикации, 2%
|
|
Венгрия
|
Венгрия, 1, 1%
Венгрия
1 публикация, 1%
|
|
Италия
|
Италия, 1, 1%
Италия
1 публикация, 1%
|
|
Латвия
|
Латвия, 1, 1%
Латвия
1 публикация, 1%
|
|
Нидерланды
|
Нидерланды, 1, 1%
Нидерланды
1 публикация, 1%
|
|
СССР
|
СССР, 1, 1%
СССР
1 публикация, 1%
|
|
10
20
30
40
50
60
70
80
|
Цитирующие организации
Цитирующие страны
- Мы не учитываем публикации, у которых нет DOI.
- Статистика пересчитывается раз в сутки.
Направления исследований
Характеристика взаимодействия белка Ku с нуклеиновыми кислотами
+
Белок Ku содержит две субъединицы, Ku70 и Ku80, и является важным участником системы репарации двуцепочечных разрывов в ДНК, где он связывается с концами ДНК. Помимо репарации он участвует и в других клеточных процессах, где также может связывать нуклеиновые кислоты. С целью характеристики влияния Ku на транскрипцию изучается взаимодействие Ku с внутренними областями ДНК. Разрабатываются также подходы к созданию ингибиторов связывания Ku с ДНК, что представляет интерес для терапии онкологических заболеваний. Показано также, что белок Ku способен связываться с определенными структурами РНК. В частности, он взаимодействует с TAR РНК, которая играет важную роль во многих этапах развития ВИЧ-1, и 7SKРНК, регулирующей транскрипцию многих генов, осуществляемую РНК-полимеразой II.
Изучение роли клеточных белков в репликации ВИЧ-1, в частности исследование влияния белков Ku и SFPQ на процессы пост-интеграционной репарации и транскрипции
+
Eng Исследование механизма действия одного из основных ферментов вируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1) – интегразы и структуры комплекса интегразы с ДНКНа основании детального кинетического исследования ферментативных реакций впервые показано, что интеграза ВИЧ-1 является практически однооборотным ферментом. Изучена стехиометрия белково-нуклеинового связывания и с помощью набора модифицированных аналогов вирусной ДНК установлено, какие участки ДНК непосредственно взаимодействуют с определенными остатками лизина в белке. С использованием методов “кросслинкинга” белка и ДНК и криоэлектронной микроскопии исследована структура комплекса интегразы с ДНК и ее клеточным кофактором – белком LEDGF/p75. В сотрудничестве с лабораториями биотехнологии и прикладной генетической фармакологии НЦНИ в г. Кашане и институтом генетики и молекулярной биологии в г. Страгбурге во Франции предложена принципиально новая модель взаимодействия интегразы с вирусной ДНК. Впервые проведено систематическое исследования ферментативных свойств и лекарственной устойчивости вариантов консенсусной интегразы ВИЧ-1 субтипа А штамма FSU-A и нового генетического варианта ВИЧ-1 CRF63_02A1, широко распространенных на территории России. Изучено влияние мутаций, вызывающих устойчивость вируса к терапевтическим препаратам - ингибиторам интеграции, на активность этих интеграз.Разработка подходов к созданию ингибиторов интегразы и обратной транскриптазы ВИЧ-1Информация, полученная при изучении структуры интегразы ВИЧ-1, использована для разработки новых ингибиторов интеграции на основе соединений различной природы, в том числе на основе коротких модифицированных олигонуклеотидов. Показано, что они являются аллостерическими ингибиторами интегразы: взаимодействуют с комплексом интегразы с вирусной ДНК и вызывают его быструю и эффективную диссоциацию. С использованием суперкомпьютеров Ломоносов и Ломоносов-2 проведено моделирование связывания наиболее эффективного олигонуклеотидного ингибитора с интегразой. Показано, что некоторые олигонуклеотидные ингибиторы интегразы ВИЧ-1 способны подавлять обратную транскрипцию в инфицированных клетках. Обнаружено также несколько новых классов низкомолекулярных органических соединений, обладающих антиинтегразной активностью. Изучение роли клеточных белков в репликации ВИЧ-1, в частности исследование влияния белков Ku и SFPQ на процессы пост-интеграционной репарации и транскрипцииЭто направление работы крайне актуально как для детального понимания развития этого опасного вируса, так и для разработки новых подходов к борьбе с ним. Основное внимание сосредоточено на изучении участия двух белков – Ku70 и SFPQ- в ранних стадиях репликативного цикла ВИЧ-1: обратной транскрипции, интеграции, пост-интеграционной репарации и транскрипции. Разработаны репортерные системы, позволяющие оценивать влияние указанных белков только на одну стадию репликативного цикла ВИЧ-1. Анализируется взаимодействие белков Ku70 и SFPQ с вирусными ферментами: интегразой и обратной транскриптазой. Впервые показано, что в пост-интеграционной репарации клеточной ДНК участвует ДНК-зависимая протеин-киназа (ДНК-ПК), которая является основным участником системы репарации двуцепочечных разрывов в ДНК по пути негомологичного соединения концов. ДНК-ПК состоит из белка Ku, который является сенсором свободного конца ДНК, и каталитической субъединицы (DNA-PKcs). Установлено, что белок Ku способен связываться с интегразой ВИЧ-1, и выявлены аминокислоты в составе интегразы, необходимые для связывания с Ku. С использованием псевдовируса, содержащего мутантную интегразу, неспособную связывать Ku, показано, что пост-интеграционная репарация начинается с привлечения белка Ku к месту интеграции именно за счет его связывания с вирусной интегразой. Далее сформированная ДНК-ПК фосфорилирует белки, непосредственно осуществляющие процесс репарации. Таким образом, комплекс интегразы и Kuможет рассматриваться как новая потенциальная мишень для анти-ВИЧ препаратов.
Разработка подходов к созданию ингибиторов интегразы и обратной транскриптазы ВИЧ-1
+
Информация, полученная при изучении структуры интегразы ВИЧ-1, использована для разработки новых ингибиторов интеграции на основе соединений различной природы, в том числе на основе коротких модифицированных олигонуклеотидов. Показано, что они являются аллостерическими ингибиторами интегразы: взаимодействуют с комплексом интегразы с вирусной ДНК и вызывают его быструю и эффективную диссоциацию. С использованием суперкомпьютеров Ломоносов и Ломоносов-2 проведено моделирование связывания наиболее эффективного олигонуклеотидного ингибитора с интегразой. Показано, что некоторые олигонуклеотидные ингибиторы интегразы ВИЧ-1 способны подавлять обратную транскрипцию в инфицированных клетках. Обнаружено также несколько новых классов низкомолекулярных органических соединений, обладающих антиинтегразной активностью.
Исследование механизма действия одного из основных ферментов вируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1) – интегразы и структуры комплекса интегразы с ДНК
+
Eng Исследование механизма действия одного из основных ферментов вируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1) – интегразы и структуры комплекса интегразы с ДНКНа основании детального кинетического исследования ферментативных реакций впервые показано, что интеграза ВИЧ-1 является практически однооборотным ферментом. Изучена стехиометрия белково-нуклеинового связывания и с помощью набора модифицированных аналогов вирусной ДНК установлено, какие участки ДНК непосредственно взаимодействуют с определенными остатками лизина в белке. С использованием методов “кросслинкинга” белка и ДНК и криоэлектронной микроскопии исследована структура комплекса интегразы с ДНК и ее клеточным кофактором – белком LEDGF/p75. В сотрудничестве с лабораториями биотехнологии и прикладной генетической фармакологии НЦНИ в г. Кашане и институтом генетики и молекулярной биологии в г. Страгбурге во Франции предложена принципиально новая модель взаимодействия интегразы с вирусной ДНК. Впервые проведено систематическое исследования ферментативных свойств и лекарственной устойчивости вариантов консенсусной интегразы ВИЧ-1 субтипа А штамма FSU-A и нового генетического варианта ВИЧ-1 CRF63_02A1, широко распространенных на территории России. Изучено влияние мутаций, вызывающих устойчивость вируса к терапевтическим препаратам - ингибиторам интеграции, на активность этих интеграз.
Публикации и патенты
Найдено
Ничего не найдено, попробуйте изменить настройки фильтра.
Юлия Юрьевна Агапкина, Марина Борисовна Готтих, Тимофей Сергеевич Зацепин, Сергей Павлович Королев, Екатерина Сергеевна Княжанская, Ольга Владимировна Кондрашина, Андрей Николаевич Анисенко
RU2515413,
2014
Jean-François MOUSCADET, Olivier Delelis, Frédéric SUBRA, Gilles Divita, Timofey Zatsepin, Yulia Agapkina, Marina Gottikh
EP2468303,
2012
Адрес лаборатории
Москва, Ленинские Горы, дом 1, стр. 40
Необходимо авторизоваться.