The Amber biomolecular simulation programs
Тип публикации: Journal Article
Дата публикации: 2005-09-30
scimago Q1
wos Q2
БС1
SJR: 0.933
CiteScore: 6.5
Impact factor: 4.8
ISSN: 01928651, 1096987X
PubMed ID:
16200636
General Chemistry
Computational Mathematics
Краткое описание
We describe the development, current features, and some directions for future development of the Amber package of computer programs. This package evolved from a program that was constructed in the late 1970s to do Assisted Model Building with Energy Refinement, and now contains a group of programs embodying a number of powerful tools of modern computational chemistry, focused on molecular dynamics and free energy calculations of proteins, nucleic acids, and carbohydrates.
Найдено
Ничего не найдено, попробуйте изменить настройки фильтра.
Для доступа к списку цитирований публикации необходимо авторизоваться.
Для доступа к списку профилей, цитирующих публикацию, необходимо авторизоваться.
Топ-30
Журналы
|
50
100
150
200
250
300
350
|
|
|
Journal of Physical Chemistry B
344 публикации, 4.11%
|
|
|
Journal of Chemical Theory and Computation
290 публикаций, 3.47%
|
|
|
Journal of Chemical Information and Modeling
279 публикаций, 3.33%
|
|
|
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
227 публикаций, 2.71%
|
|
|
Physical Chemistry Chemical Physics
191 публикация, 2.28%
|
|
|
PLoS ONE
152 публикации, 1.82%
|
|
|
Scientific Reports
141 публикация, 1.68%
|
|
|
Journal of Chemical Physics
137 публикаций, 1.64%
|
|
|
Journal of Computational Chemistry
136 публикаций, 1.63%
|
|
|
Molecules
130 публикаций, 1.55%
|
|
|
International Journal of Molecular Sciences
129 публикаций, 1.54%
|
|
|
Journal of Biological Chemistry
122 публикации, 1.46%
|
|
|
Proteins: Structure, Function and Genetics
117 публикаций, 1.4%
|
|
|
Nucleic Acids Research
112 публикаций, 1.34%
|
|
|
Journal of Molecular Modeling
109 публикаций, 1.3%
|
|
|
Biochemistry
108 публикаций, 1.29%
|
|
|
Biophysical Journal
107 публикаций, 1.28%
|
|
|
Journal of Molecular Graphics and Modelling
100 публикаций, 1.2%
|
|
|
Nature Communications
92 публикации, 1.1%
|
|
|
Journal of the American Chemical Society
90 публикаций, 1.08%
|
|
|
Methods in Molecular Biology
89 публикаций, 1.06%
|
|
|
Journal of Molecular Biology
85 публикаций, 1.02%
|
|
|
Journal of Computer-Aided Molecular Design
82 публикации, 0.98%
|
|
|
International Journal of Biological Macromolecules
68 публикаций, 0.81%
|
|
|
ACS Omega
60 публикаций, 0.72%
|
|
|
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
59 публикаций, 0.71%
|
|
|
European Journal of Medicinal Chemistry
57 публикаций, 0.68%
|
|
|
Journal of Medicinal Chemistry
52 публикации, 0.62%
|
|
|
RSC Advances
49 публикаций, 0.59%
|
|
|
50
100
150
200
250
300
350
|
Издатели
|
200
400
600
800
1000
1200
1400
1600
1800
|
|
|
Elsevier
1612 публикаций, 19.26%
|
|
|
American Chemical Society (ACS)
1597 публикаций, 19.08%
|
|
|
Springer Nature
1090 публикаций, 13.03%
|
|
|
Wiley
888 публикаций, 10.61%
|
|
|
MDPI
474 публикации, 5.66%
|
|
|
Royal Society of Chemistry (RSC)
398 публикаций, 4.76%
|
|
|
Taylor & Francis
392 публикации, 4.68%
|
|
|
Cold Spring Harbor Laboratory
276 публикаций, 3.3%
|
|
|
Public Library of Science (PLoS)
210 публикаций, 2.51%
|
|
|
Oxford University Press
202 публикации, 2.41%
|
|
|
AIP Publishing
155 публикаций, 1.85%
|
|
|
Frontiers Media S.A.
139 публикаций, 1.66%
|
|
|
American Society for Biochemistry and Molecular Biology
122 публикации, 1.46%
|
|
|
Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS)
59 публикаций, 0.71%
|
|
|
Bentham Science Publishers Ltd.
49 публикаций, 0.59%
|
|
|
Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
44 публикации, 0.53%
|
|
|
Pleiades Publishing
43 публикации, 0.51%
|
|
|
eLife Sciences Publications
36 публикаций, 0.43%
|
|
|
American Association for the Advancement of Science (AAAS)
34 публикации, 0.41%
|
|
|
IOP Publishing
29 публикаций, 0.35%
|
|
|
American Physical Society (APS)
27 публикаций, 0.32%
|
|
|
World Scientific
26 публикаций, 0.31%
|
|
|
American Society for Microbiology
22 публикации, 0.26%
|
|
|
Association for Computing Machinery (ACM)
21 публикация, 0.25%
|
|
|
Hindawi Limited
19 публикаций, 0.23%
|
|
|
SAGE
17 публикаций, 0.2%
|
|
|
Portland Press
16 публикаций, 0.19%
|
|
|
American Society for Pharmacology and Experimental Therapeutics
11 публикаций, 0.13%
|
|
|
Impact Journals
11 публикаций, 0.13%
|
|
|
200
400
600
800
1000
1200
1400
1600
1800
|
- Мы не учитываем публикации, у которых нет DOI.
- Статистика публикаций обновляется еженедельно.
Вы ученый?
Создайте профиль, чтобы получать персональные рекомендации коллег, конференций и новых статей.
Метрики
8.4k
Всего цитирований:
8373
Цитирований c 2025:
695
(8.31%)
Цитировать
ГОСТ |
RIS |
BibTex |
MLA
Цитировать
ГОСТ
Скопировать
Case D. B. et al. The Amber biomolecular simulation programs // Journal of Computational Chemistry. 2005. Vol. 26. No. 16. pp. 1668-1688.
ГОСТ со всеми авторами (до 50)
Скопировать
Case D. B., Cheatham T. E., Darden T., Gohlke H., Luo R., Merz Jr K. M., Onufriev A., Simmerling C., Wang B., Woods R. M. The Amber biomolecular simulation programs // Journal of Computational Chemistry. 2005. Vol. 26. No. 16. pp. 1668-1688.
Цитировать
RIS
Скопировать
TY - JOUR
DO - 10.1002/jcc.20290
UR - https://doi.org/10.1002/jcc.20290
TI - The Amber biomolecular simulation programs
T2 - Journal of Computational Chemistry
AU - Case, D B
AU - Cheatham, Thomas E.
AU - Darden, Tom
AU - Gohlke, H
AU - Luo, Ray
AU - Merz Jr, K. M.
AU - Onufriev, Alexey
AU - Simmerling, Carlos
AU - Wang, Bing
AU - Woods, Robert M.
PY - 2005
DA - 2005/09/30
PB - Wiley
SP - 1668-1688
IS - 16
VL - 26
PMID - 16200636
SN - 0192-8651
SN - 1096-987X
ER -
Цитировать
BibTex (до 50 авторов)
Скопировать
@article{2005_Case,
author = {D B Case and Thomas E. Cheatham and Tom Darden and H Gohlke and Ray Luo and K. M. Merz Jr and Alexey Onufriev and Carlos Simmerling and Bing Wang and Robert M. Woods},
title = {The Amber biomolecular simulation programs},
journal = {Journal of Computational Chemistry},
year = {2005},
volume = {26},
publisher = {Wiley},
month = {sep},
url = {https://doi.org/10.1002/jcc.20290},
number = {16},
pages = {1668--1688},
doi = {10.1002/jcc.20290}
}
Цитировать
MLA
Скопировать
Case, D. B., et al. “The Amber biomolecular simulation programs.” Journal of Computational Chemistry, vol. 26, no. 16, Sep. 2005, pp. 1668-1688. https://doi.org/10.1002/jcc.20290.