Лаборатория химии нуклеопротеидов, кафедра Химии природных соединений, Химический факультет

Заведующий лабораторией

Донцова Ольга Анатольевна

д.х.н., проф., академик, Российская академия наук
Публикаций
234
Цитирований
4 677
Индекс Хирша
38
Необходимо авторизоваться.

Лаборатория обладает широким спектром направлений исследований:

  1. Изучение рибосомы
  2. Поиск новых антибиотиков и изучение механизма их действия
  3. Изучение теломеразы
  4. Генетические основы канцерогенеза
  5. Поиск противораковых соединений
  6. Изучение аутофагии
  7. Поиск и изучение новых малых открытых рамок считывания 
  8. Получение и изучение трансгенных клеточных линий и животных
  9. Структура белков методом ЯМР
  10. ЯМР-метаболомика
  1. CRISPR-Cas
  2. Вестерн-блот
  3. Культура клеток и тканей
  4. Toe-print
  5. ПЦР-РВ
  6. Работа с лабораторными животными
  7. Работа с бактериальными штаммами
  8. Клонирование
  9. Секвенирование по Сенгеру
  10. Выделение и очистка целевых белков
  11. In vitro трансляция
  12. Саузерн-блот
  13. Нозерн-блот
  14. Масс-спектрометрия
  15. Создание генноинженерных конструкций для экспрессии целевых белков
  16. Работа с прокариотическими клетками: культивирование, трансформация, работа с фагами
  17. Работа с эукариотическими клетками: культивирование, трансфекция, инфекция
  18. Выделение рибонуклеопротеидных комплексов, работа с рибосомами и их комплексами
  19. Аффинная хроматография
  20. Ультрацентрифугирование
  21. FISH (Флуоресцентная гибридизация in situ)
  22. Гель-электрофорез

Спектрофотометр, используется для количественной оценки и оценки чистоты ДНК, РНК, белка и многого другого. Микрообъемный спектрофотометр с запатентованной технологией удержания образцов, который измеряет объемы образцов размером всего 0,5 мкл.

Роботизированная станция Janus позволяет осуществлять высокопроизводительный скрининг. Систему можно запрограммировать определенным образом на раскапывание образцов.

Система для быстрого переноса белков из геля на мембрану. Используется при проведении вестерн-блоттинга.

Система для проведения вертикального электрофореза полиакриламидных гелей небольших размеров. Система идеально подходит для разделения и анализа белков, в том числе методами вестерн-блоттинга.

Источник тока для проведения гель-электрофореза.

Система обеспечивает точную количественную оценку и распознавание целевых фрагментов ДНК (до 5 мишеней) в реакциях большого объема. Система включает в себя передовые в отрасли технологии и автономную функциональность, чтобы обеспечить надежный и простой в использовании инструмент qPCR (ПЦР-РВ) для получения надежных результатов.

Самая быстрая система визуализации хемилюминесценции, флуоресценции и колориметрии. Управляется программным обеспечением для захвата и анализа изображений Image Lab.

Быстрый неконфокальный лазерный сканер для образцов: окрашенных гелей, флуоресцентно-меченных красителем, хемилюминесцентных блотов, меченных радиоизотопами

Количественный анализ (белки, нуклеиновые кислоты, клетки, бактерии и др.), скрининга лекарственных препаратов и метаболитов, иммуноферментный анализ, для кинетических и токсикологических исследований в клеточной биологии и цитологии.

Лабораторный пикник
Лабораторный пикник
Лабораторный новый год
Лабораторный новый год
Комната для смешивания реакционных смесей для ПЦР: тут расположены ПЦР-боксы и хранятся полимеразы
Комната для смешивания реакционных смесей для ПЦР: тут расположены ПЦР-боксы и хранятся полимеразы
Лабораторная комната общего назначения. Справа расположен секвенатор.
Лабораторная комната общего назначения. Справа расположен секвенатор.
Комната для работы с РНК. В ней можно работать только в перчатках, сюда запрещено вносить образцы, содержащие ДНК и белки.
Комната для работы с РНК. В ней можно работать только в перчатках, сюда запрещено вносить образцы, содержащие ДНК и белки.
Комната для работы с эукариотическими клеточными линиями. Здесь расположено 4 ламинара и 2 инкубатора.
Комната для работы с эукариотическими клеточными линиями. Здесь расположено 4 ламинара и 2 инкубатора.
Микроскопы для работы с клеточными культурами
Микроскопы для работы с клеточными культурами
Бактериальный блок. Здесь в основном занимаемся клонированием.
Бактериальный блок. Здесь в основном занимаемся клонированием.
Робот для проведения тестирования биологически-активных веществ на клеточных культурах
Робот для проведения тестирования биологически-активных веществ на клеточных культурах
Комната для работы с ДНК: проведение ПЦР и гель-электрофореза
Комната для работы с ДНК: проведение ПЦР и гель-электрофореза
Комната для работы с эукариотическими клеточными линиями. Здесь расположено 4 ламинара и 2 инкубатора.
Комната для работы с эукариотическими клеточными линиями. Здесь расположено 4 ламинара и 2 инкубатора.
Ольга Донцова
Заведующий лабораторией
Петр Сергиев
Ведущий научный сотрудник
Радик Шафиков
Младший научный сотрудник
Комарова Екатерина Сергеевна
Екатерина Комарова
Младший научный сотрудник
Шепелев Никита
Никита Шепелев
Младший научный сотрудник
Александр Руденко 🥼
Младший научный сотрудник
Софья Марьясина 🥼 🤝
Младший научный сотрудник
Никандрова Арина А
Арина Никандрова
Стажёр-исследователь
Елизавета Разумова 🥼 🤝
Аспирант
Инна Волынкина 🥼
Аспирант
Айсин Камиль
Камиль Айсин 🥼 🤝
Студент

Направления исследований

Первичное биотестирование de novo синтезированных химических препаратов

+
Первичное биотестирование
de novo синтезированных химических препаратов
Данное направление подразумевает оценку цитотоксичности, в т.ч. дифференциальной, оценку непосредственного химического повреждения препаратами ДНК, адресный анализ предполагаемых мишеней препаратов (деблокирование в клетке белка p53, оценку ингибирования теломеразы, связывание с андрогеновыми рецепторами, ингибирование PSMA и др.). Работа ведется в тесном сотрудничеств с несколькими синтетическими группами на химическом факультете (на 3-м курсе студенты смогут сами “сварить” вещества в рамках курсовой работы по орг. химии и сами проверить их биологическое действие).

Изучение теломеразы

+
Изучение структурно-функциональных особенностей теломеразы с использованием в качестве модельной системы простейшего эукариотического организма – дрожжей Hansenula polymorpha. Термотолерантность этого вида дрожжей обеспечивает стабильность белков, что позволяет проводить структурные исследования компонентов теломеразы. Исследования теломеразы высших эукариот (в т.ч. изучение человека). Предметом особенного интереса является регуляция экспрессии основных компонентов теломеразы в человеческих клетках, биогенез теломеразной РНК и альтернативные функции фермента, не связанные с синтезом теломерной ДНК.

Поиск новых антибиотиков

+
Антибиотики подавляют рост клеток или приводят к их смерти. В отделе создана система высокопроизводительного скрининга потенциальных антибактериальных и цитотоксических препаратов, которая используется для анализа обширных коллекций соединений, как синтетического, так и природного происхождения. Репортная система, используемая в бактериях, позволяет на самом первом этапе скрининга выявить соединения, приводящие к ингибированию биосинтеза белка или ДНК. Коллекции соединений используются для поиска ингибиторов роста клеток эукариот. Скрининг токсичных против опухолевых клеток веществ позволяет выявлять соединения, преимущественно ингибирующие жизнедеятельность раковых клеток и не влияющие на выживаемость нормальных клеток в клеточной модели опухолевого микроокружения.

Изучение РНК-метилтрансфераз

+
Известно большое разнообразие различных дополнительных химических функциональных групп, которые присоединяются к нуклеотидам путем специфической модификации в клетке. Модифицированные основания в составе РНК играют важную роль в регуляции функционирования, структуры, как самих РНК, так и РНК-белковых комплексов. Многолетние исследования РНК-метилтрансфераз бактерий позволили выявить эволюционный аспект функционирования метилтрансфераз в клетках эукариот. Бионформатический анализ позволяет выявлять новые гены потенциальных РНК-метилтраснфераз, а последующие экспериментальные подходы идентифицировать ферменты и определять их мишени, а также влияние на функционирование клеток. В работе используются современные подходы, в том числе геномное редактирование при помощи системы CRISPR/Cas9 в линиях клеток эукариот и в лабораторных животных.

Публикации и патенты

Найдено 
Головина А. Я., Дзама М. М., Остерман И. А., Сергиев П. В., Серебрякова М. В., Богданов А. А., Донцова О. А.
RU2522863, 2014
Остерман И. А., Андреянова Е. С., Сергиев П. В., Евфратов С. А., Донцова О. А., Иваненков Я. А., Лаптев И. Г., Плетнев Ф. И., Марусич Е. И., Леонов С. В., Головина А. Я.
RU2620074, 2017
Мажуга А. Г., Зверева М. Э., Агрон Л. А., Белоглазкина Е. К., Ворожцов Н. И., Донцова О. А., Зык Н. В., Киселев Ф. Л., Скворцов Д. А.
RU2468030, 2012

Партнёры

Адрес лаборатории

Москва, Ленинские Горы, дом 1, стр. 40
Необходимо авторизоваться.