Заведующий лабораторией

Колесников Станислав Сергеевич

д.б.н., проф., ч.-к., Российская академия наук
Публикаций
77
Цитирований
2 213
Индекс Хирша
20
Необходимо авторизоваться.

В процессе жизни клетки воспринимают внешние сигналы и генерируют ответы на них. Эти процессы связаны между собой бескрайней сетью упорядоченных и взаимосвязанных преобразований внутриклеточных молекул, которые обобщенно называют внутриклеточной сигнализацией. В нашей лаборатории занимаются изучением механизмов передачи сигналов от рецептора вглубь клетки с помощью физиологических экспериментов на одиночных клетках.

Интереснейшим объектом для исследования внутриклеточных сигнальных систем являются сенсорные клетки. Вкусовые клетки в ответ на стимуляцию вкусовыми молекулами возбуждаются и передают информацию о его качествах вкусовому нерву. Основные этапы механизма формирования сигнала о вкусовом стимуле установлены, однако существует множество вопросов, ответы на которые до сих пор не получены. Наша работа призвана заполнить пробелы в понимании внутриклеточных процессов, лежащих в основе формирования вкуса на самых ранних этапах восприятия

Невозбудимые клетки тоже воспринимают внешние сигналы, и механизмы их передачи внутрь клетки изучены далеко не до конца. Безграничные возможности для исследования таких процессов предоставляют клетки культуральных линий, в которые можно «встраивать» новые молекулы или «выключать» существующие.

Отметим, что методы исследования внутриклеточной сигнализации универсальны и могут быть применены к клеткам любых типов. В нашей лаборатории отработаны уникальные методики регистрации ионных токов клетки (patch clamp), мониторинга внутриклеточного кальция (Ca2+-imaging) и других сигнальных молекул, фотолиза химических групп (uncaging), а также их одновременное использование. Используя методы молекулярной и клеточной биологии, мы «встраиваем» или «выключаем» в клетках интересующие нас рецепторы или другие молекулы, также мы получаем новые линии клеток, несущие флуоресцентные сенсоры ключевых сигнальных молекул. Используя упомянутые методы и инструменты в комплексе, мы получаем уникальные данные о механизмах передачи внутриклеточных сигналов, которые расширяют фундаментальные представления и ложатся в основу математических моделей функционирования клетки.

  1. Математическое моделирование
  2. Метод локальной фиксации потенциала (Patch clamp)
  3. Мониторинг внутриклеточных молекул с помощью флуоресцентных зондов и сенсоров (Ca2+, cAMP и др)
  4. Работа с клетками эукариот: трансфекция, получение стабильных клеточных линий
  5. Технология редактирования генома CRISPR/Cas9

Установка позволяет проводить физиологические эксперименты по фотометрированию одиночных клеток, то что называется "кальциевый имиджинг", а также имиджинг любых других внутриклеточных молекул, для которых существуют флуоресцентные зонды или сенсоры

Установка состоит из: флуоресцентного микроскопа Axiovert 200 (Zeiss), EMCCD камеры iXon 888 (Andor Technology), осветителя на сверхъярких диодах (самосборка), управляющей программы Imaging Workbench 6 (Indec), а также системы перфузии.

Методика для изучения свойств ионных каналов, состоящая в том, что фрагмент клеточной мембраны изолируется с помощью специальной микропипетки. Эта методика даёт возможность экспериментатору контролировать разность потенциалов между сторонами мембраны, а также помещать её в среду с определённым химическим составом. В этих хорошо контролируемых условиях измеряют ионные токи, проходящие через мембрану, что, в конечном итоге, позволяет делать выводы о том, как ионные каналы реагируют на электрическое и химическое воздействие. Метод настолько чувствителен, что позволяет наблюдать поведение и химические превращения единичных молекул, взаимодействующих с мембраной.

Станислав Колесников
Заведующий лабораторией
Полина Котова 🥼
Ведущий научный сотрудник
Клим Сладков 🥼
Младший научный сотрудник

Направления исследований

Тестирование лекарственных соединений с помощью клеток-сенсоров

+
Тестирование лекарственных соединений с помощью клеток-сенсоров
В идеале лекарственные вещества должны воздействовать на молекулу-мишень и связанные с ней сигнальные процессы, но при этом не влиять на другие молекулы. Однако в большинстве случаев лекарственные соединения не обладают такой специфичностью, и их применение приводит к развитию побочных эффектов. Поэтому важно иметь как можно более полные представления о влиянии используемых соединений на внутриклеточные процессы, а разработка методов и инструментов для проведения соответствующих исследований задача очень актуальная. Мы создаем линии клеток, несущих в себе генетически кодируемые флуоресцентные сенсоры важнейших сигнальных молекул. Такие клетки позволяют проводить мониторинг одной или нескольких внутриклеточных молекул в режиме реального времени. Так, например, полученные нами клетки-сенсоры позволили установить, что ингибиторы внутриклеточного фермента PI3-киназы, использующиеся для лечения онкологических заболеваний, воздействуют не только на целевую молекулу, но имеют и дополнительные мишени. Эти соединения блокируют рецепторы клеток к ацетилхолину, гистамину и серотонину, что приводит к угнетению важнейших сигнальных процессов во всем организме. Исследовавшиеся соединения вызывают широчайший спектр побочных эффектов, часть из которых может быть связана именно с обнаруженным нами их нецелевым действием.

Получение модельных клеточных систем для исследования сигнальных процессов

+
Получение модельных клеточных систем для исследования сигнальных процессов
Традиционно механизмы передачи сигнала внутри клетки исследуют в физиологических экспериментах с помощью ингибиторного анализа, используя агонисты и антагонисты рецепторов, блокаторы и модуляторы ионных каналов, ингибиторы и активаторы ферментов. Однако один стимул может активировать в клетке одновременно несколько сигнальных процессов, которые в свою очередь могут влиять друг на друга. В связи с этим результаты физиологических экспериментов зачастую сложно трактовать однозначно, что значительно затрудняет исследование механизмов внутриклеточной сигнализации. Сложности такого рода иногда можно преодолеть с помощью искусственно созданных клеточных систем. Так, например, мы умеем «встраивать» молекулы интереса в нехарактерную для них клеточную систему, где они не будут подвергаться специфической регуляции. Также мы можем «выключить» молекулу для подтверждения её участия в исследуемом процессе или для прекращения её воздействия на этот процесс. Для создания таких модельных клеточных систем мы используем передовые методы молекулярной и клеточной биологии, включая создание плазмидных векторов, содержащих гены белков интереса, технологию редактирования генома CRISPR/Cas9 и методики получения моноклональных линий эукариотических клеток.

Сигнальные процессы во вкусовой почке

+
Сигнальные процессы во вкусовой почке
Вкусовые ощущения формируются в органе вкуса - вкусовой почке. Парочка клеток в почке регистрирует кислое, ещё пару десятков - горькое, сладкое и умами, другие клетки регистрируют солёное и помогают другим выполнять их функции. Как они это делают - до конца никто не знает. В нашей лаборатории налажена методика извлечения отдельных вкусовых клеток из эпителия языка мыши и их дальнейшее изучение. Регистрируется электрическая активность клеток (методом patch-clamp) и сигнальные процессы (микрофотометрия, фотолиз химических групп). Результаты сравниваются с разрабатываемой компьютерной моделью вкусовой почки. Если вам интересно, что такое вкус - мы единственные в России, кто отвечает на этот вопрос на языке молекул и клеточных коммуникаций.

Публикации и патенты

Найдено 

Адрес лаборатории

г. Пущино Московской области, Институтская, 3, ИБК РАН
Необходимо авторизоваться.