19 January 2024, 20:00

Вирусы бактерий используют механическую силу, чтобы пробиться через О-антиген

О-антигены – это полисахаридная структура, присутствующая на внешнем листке поверхности мембраны большинства грамотрицательных бактерий, например, у многих штаммов кишечной палочки (E. coli). В каком-то смысле эта структура напоминает растущую на поверхности бактерии шерсть, но состоящую не из белка кератина (как волосы животных), а из полисахаридных цепочек. Более того, структура О-антигенов сильно варьируется от штамма к штамму. Так, например, в пределах вида E. coli насчитывается порядка 200 различных О-серотипов.

Научный обзор, подготовленный Андреем Летаровым, д.б.н., заведующим лабораторией вирусов микроорганизмов ФИЦ Биотехнологии РАН, представляет анализ многолетних исследований и обобщает совокупность доказательств, показывающих, что у большинства видов E.coli слой О-антигена настолько плотный, что он эффективно защищает клетки от атаки вирусами бактерий – бактериофагами.

Можно сказать, что О-антигены полностью «экранируют» клетки, предотвращая доступ фагов к их поверхности. Этот «щит» не только блокирует вирулентные фаги, но и ограничивает приобретение профагов.

Защищенные таким образом клетки могут спокойно расти в окружении большого числа потенциально смертельных для нее вирусов, не обращая на них внимания. Однако, бактериофаги, в свою очередь, приобрели специальные молекулярные приспособления, позволяющие им преодолевать барьер О-антигена и заражать защищенные клетки.

При этом имеющиеся у отдельного фага «ключи» подходят для одних типов О-антигена и бессильны против иных. Одной из вероятных причин природной вариабельности О-антигенов, по мнению ученых, является именно непрекращающаяся борьба с фаговой инфекцией.

Хотя само по себе явление защиты клетки О-антигеном было описано еще в 1986 году, до недавнего времени оно практически игнорировалось большинством исследователей, поскольку лабораторные штаммы E. coli, на которых выполнялись многие исследования бактериофагов, из-за мутаций потеряли способность к синтезу О-антигена, можно сказать «облысели».

Работы ученых ФИЦ Биотехнологии РАН доказали, что в природных условиях явление защиты клеток О-антигеном широко распространено и имеет большую экологическую значимость. В виду неспецифического характера этой защиты, она скорее всего работает не только у E. coli, но и у многих других бактерий, способных к синтезу достаточно длинных О-полисахаридов.

Кроме этого, исследователями были расшифрованы механизмы, с помощью которых некоторые фаги проникают через защитный барьер О-антигена.

«Сопоставляя наши данные и результаты других исследователей, мы пришли к выводу, что в подавляющем большинстве случаев вирусы бактерий используют механическую силу, чтобы в прямом смысле слова пробиться через слой О-антигена. Именно поэтому мы употребили в названии статьи слово «форсирование» по аналогии с военным термином. Механизм создания механического усилия может быть очень разным, от молекулярных моторов, использующих ферментативные реакции, до разнообразных перестроек самой вирусной частицы в момент инфицирования клетки» – рассказывает автор работы, Андрей Летаров.

Научная статья опубликована в журнале International Journal of Molecular Science.

Source:  Пресс-служба ФИЦ Биотехнологии РАН

News article publications

Read also

Раскрыто, что некоторые белки помогают вирусам проникнуть в бактериальную клетку
Белки семейства ArdA помогают вирусам проникнуть в бактериальную клетку, приняв образ ее ДНК. Проведя фундаментальные исследования, ученые Центра исследований молекулярных механизмов старения и возрастных заболеваний МФТИ и НИЦ «Курчатовский институт» показали, что такие белки не только подавляют защиту клеток, но и регулируют целый ряд других клеточных процессов. Результаты исследования заложили основу для будущих прикладных работ в области генной терапии.
Bacteriology
Genetics
Virology
31 January 2024
Получена молекулярная структура бактериофага DT57C, поражающего кишечную палочку
Ученые из ФИЦ Биотехнологии РАН и Биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова совместно с исследователями из Окинавского университета (Япония) и совместного Российско-Китайского университете МГУ-ППИ (Шэнчьжэнь, Китай) получили впервые практически полную молекулярную структуру бактериофага DT57C — вируса, поражающего бактерий Escherichia coli. Поскольку бактериофаги рассматриваются в качестве перспективного агента для борьбы с бактериальными инфекциями, в том числе вызванными E.coli (кишечные, урологические, раневые и другие инфекции), новые знания могут быть полезны при разработке новых лекарственных препаратов.
Bacteriology
Molecular Biology
Virology
28 December 2023
Лучшие субстраты для выращивания бактерий, очищающих сточные воды от фосфатов
Ученые из ФИЦ Биотехнологии РАН выяснили, что бактерии Accumulibacter, используемые для очистки сточных вод от фосфатов, способны расти на многих органических субстратах, включая органические кислоты и аминокислоты. При этом наиболее легким для «усвоения» оказался ацетат — соль летучей органической кислоты. Использование бактериями этих субстратов сопровождалось «жадным поглощением» фосфатов из среды. Полученные данные помогут подобрать оптимальные условия для выращивания бактерий, участвующих в очистке сточных вод от фосфоросодержащих загрязнителей.
Bacteriology
Bioorganic chemistry
Microbiology
16 December 2023
Метагеномные технологии помогут понять, как увеличить эффективность нефтедобычи
Ученые из ФИЦ Биотехнологии РАН охарактеризовали состав микроорганизмов четырех нефтяных месторождений на территории Татарстана. Оказалось, что в пластовой воде обитают как бродильные бактерии, образующие нефтевытесняющие метаболиты, так и сульфатредуцирующие бактерии, образующие сероводород, вызывающий коррозию стального оборудования, порчу нефти и экологические проблемы. Это указывает на то, что повысить нефтеотдачу пластов можно, внося в них с поверхности органические вещества для стимуляции роста бродильных бактерий, а также предусматривать применение методов конкурентного подавления роста сульфидогенов.
Bacteriology
Microbiology
Petrochemicals
15 December 2023
Определено, что сульфиды не блокируют бактерии, очищающие сточные воды
Ученые определили, что сульфиды подавляют, но не блокируют окисление аммония бактериями, используемыми для очистки сточных вод. Эксперимент показал, что сульфиды негативно сказываются на жизнедеятельности нитрифицирующих микроорганизмов, но практически не влияют на анаммокс-бактерий. В результате, поскольку и первые, и вторые вовлечены в общий процесс окисления аммония, его эффективность при высоких концентрациях сульфидов снижается только на 17%. Эти данные говорят о возможности использовать бактериальную очистку и для сточных вод, загрязненных сульфидами.
Bacteriology
Genetics
Microbiology
14 December 2023
Ферменты бактериофагов помогут победить внутрибольничные инфекции
Бактериальные вирусы узнают патогенную бактерию благодаря деполимеразе хвостового шипа. Последняя разрезает разветвленные молекулы полисахаридов во внешней оболочке бактерии и тем самым способствует ее гибели
Microbiology
Pharmacy
Virology
3 July 2023