Лаборатория структурной биологии

Разработка современных методов терапии и диагностики различных заболеваний, оптимизация биотехнологических процессов на сегодняшний день требует установления молекулярной структуры участвующих в них биополимеров и механизмов протекающих молекулярно-биологических процессов. Все более часто встречаются процессы, в которых важна не столько статическая структура, сколько динамика и молекулярные перестройки биомолекулярных систем при реализации внутри- и межмолекулярных взаимодействий. Только использование совокупности экспериментальных подходов (например, рентгеновской кристаллографии, ядерного магнитного резонанса, криоэлектронной микроскопии и малоуглового рентгеновского рассеяния и др.) с методами компьютерного моделирования (построения молекулярных моделей и их моделирования) и анализа позволяет решать данные задачи. Целью исследования является изучение структуры и динамики белков и белково-нуклеиновых комплексов для решения задач биофармацевтики и диагностики для борьбы с социально-значимыми заболеваниями. В рамках этого в 2021-2023 гг. будет рассмотрено взаимодействие нуклеиновых кислот (в том числе комплексов с нетипичной пространственной организацией и/или несущих функциональные группы) с НК-процессирующими ферментами (ДНК-полимеразами, ДНК-лигазами и нуклеазами), а так же белком-переносчиком - альбумином. При изучении конформационно лабильных белков будет изучена структура и динамика частично неструктурированных белков: протеазы вируса Денге (NS2B/NS3) и неструктурного белка 1 (non-structural protein 1, nsp1) вируса SARS-CoV-2. Кроме того, будет проанализировано взаимодействие белкового комплекса NS2B/NS3 с его потенциальным ингибитором.