Лаборатория эпидемиологически и социально значимых инфекций
Руководитель
Огарков Олег Борисович
Публикаций
95
Цитирований
710
Индекс Хирша
13
Необходимо авторизоваться.
Основное направление деятельности подразделения — эпидемиологические и микробиологические исследования актуальных инфекций от популяционного уровня, до уровня отдельных организмов. Помимо традиционных для лаборатории направлений — «эпидемиология социально-значимых инфекций» и «молекулярная эпидемиология туберкулеза», коллективом лаборатории проводятся исследования по ряду перспективных направлений, таких как, «исследование фармакокинетики протвотуберкулезных препаратов», «поиск новых биомаркеров актуальных инфекционных заболеваний методами полногеномного секвенирования», «исследования микробиом легких при туберкулезном процессе».
- Next Generation Sequencing (NGS)
- Иммуноферментный анализ (ИФА)
- ПЦР-РВ
- Работа с прокариотическими клетками: культивирование, трансформация, работа с фагами
- Создание генноинженерных конструкций для экспрессии целевых белков
- Вестерн-блот
- Клонирование
- Секвенирование
- Гель-электрофорез
Олег Огарков
Руководитель
Евгений Савилов
Главный научный сотрудник
Светлана Жданова
Ведущий научный сотрудник
Вячеслав Синьков
Старший научный сотрудник
Илья Кондратов
Научный сотрудник
Всего публикаций
85
Всего цитирований
699
Цитирований на публикацию
8.22
Среднее число публикаций в год
3.15
Годы публикаций
1998-2024 (27 лет)
h-index
13
i10-index
19
m-index
0.48
o-index
28
g-index
23
w-index
4
Описание метрик
h-index
Учёный имеет индекс h, если h из его N статей цитируются как минимум h раз каждая, в то время как оставшиеся (N - h) статей цитируются не более чем h раз каждая.
i10-index
Число статей автора, получивших не менее 10 ссылок каждая.
m-index
m-индекс ученого численно равен отношению его h-индекса к количеству лет, прошедших с момента первой публикации.
o-index
Среднее геометрическое h-индекса и числа цитирований наиболее цитируемой статьи ученого.
g-index
Для данного множества статей, отсортированного в порядке убывания количества цитирований, которые получили эти статьи, g-индекс это наибольшее число, такое что g самых цитируемых статей получили (суммарно) не менее g2 цитирований.
w-index
Если w статей ученого имеют не менее 10w цитирований каждая и другие статьи меньше, чем 10(w+1) цитирований, то w-индекс исследователя равен w.
Топ-100
Области наук
Журналы
Цитирующие журналы
Цитируемые журналы
Издатели
Организации из публикаций
Страны из публикаций
|
10
20
30
40
50
60
70
80
|
|
|
Россия
|
Россия, 72, 84.71%
Россия
72 публикации, 84.71%
|
|
США
|
США, 18, 21.18%
США
18 публикаций, 21.18%
|
|
Страна не определена
|
Страна не определена, 16, 18.82%
Страна не определена
16 публикаций, 18.82%
|
|
Бангладеш
|
Бангладеш, 4, 4.71%
Бангладеш
4 публикации, 4.71%
|
|
Танзания
|
Танзания, 4, 4.71%
Танзания
4 публикации, 4.71%
|
|
Таиланд
|
Таиланд, 3, 3.53%
Таиланд
3 публикации, 3.53%
|
|
Казахстан
|
Казахстан, 2, 2.35%
Казахстан
2 публикации, 2.35%
|
|
Китай
|
Китай, 2, 2.35%
Китай
2 публикации, 2.35%
|
|
Франция
|
Франция, 1, 1.18%
Франция
1 публикация, 1.18%
|
|
Португалия
|
Португалия, 1, 1.18%
Португалия
1 публикация, 1.18%
|
|
Албания
|
Албания, 1, 1.18%
Албания
1 публикация, 1.18%
|
|
Бельгия
|
Бельгия, 1, 1.18%
Бельгия
1 публикация, 1.18%
|
|
Болгария
|
Болгария, 1, 1.18%
Болгария
1 публикация, 1.18%
|
|
Бразилия
|
Бразилия, 1, 1.18%
Бразилия
1 публикация, 1.18%
|
|
Великобритания
|
Великобритания, 1, 1.18%
Великобритания
1 публикация, 1.18%
|
|
Греция
|
Греция, 1, 1.18%
Греция
1 публикация, 1.18%
|
|
Латвия
|
Латвия, 1, 1.18%
Латвия
1 публикация, 1.18%
|
|
Монголия
|
Монголия, 1, 1.18%
Монголия
1 публикация, 1.18%
|
|
Нидерланды
|
Нидерланды, 1, 1.18%
Нидерланды
1 публикация, 1.18%
|
|
Швеция
|
Швеция, 1, 1.18%
Швеция
1 публикация, 1.18%
|
|
ЮАР
|
ЮАР, 1, 1.18%
ЮАР
1 публикация, 1.18%
|
|
Япония
|
Япония, 1, 1.18%
Япония
1 публикация, 1.18%
|
|
10
20
30
40
50
60
70
80
|
Цитирующие организации
Цитирующие страны
- Мы не учитываем публикации, у которых нет DOI.
- Статистика пересчитывается раз в сутки.
Направления исследований
Комплексный подход к молекулярной диагностике МЛУ/ШЛУ туберкулеза с разработкой информационно-аналитической системы для персонализированной медицины и эпидемиологического надзора
+
Mycobacterium tuberculosis является наиболее летальным инфекционным возбудителем. В последние десятилетия в результате больших достижений в области молекулярной биологии наши знания о механизмах устойчивости M. tuberculosis к основным противотуберкулезным препаратам расширились благодаря выявлению специфических генных мутаций, связанных с устойчивостью к ПТП. Одним из наиболее многообещающих подходов генетического определения устойчивости к ПТП является полногеномное секвенирование (WGS) и последующая автоматизированная интерпретация данных с помощью пакетов программ. В задачи проекта входят:
Задача по автоматизации аналитического процесса выявления значимых мутаций для пиразинамида, линезолида, деламанида и бедаквилина при секвенировании по Сэнгеру;
Задача по разработке панели праймеров и TaqMan зондов для ПЦР-РВ идентификации основных (эпидемических) генотипов M. tuberculosis, циркулирующих в Северной Евразии;
Задача по исследованию роли сателлитной анаэробной микробиоты туберкулезного очага в процессах выживания МБТ в модели in vitro.
Биоразнообразие нетуберкулезных микобактерий, полученных из культивированных штаммов и клинических образцов от больных, в Европейских и Азиатских регионах России
+
В настоящее время описано 200 видов нетуберкулезных микобактерий (НТМБ) постоянно находящихся в окружающей среде. Можно ожидать, что расширение иммунокомпроментированной прослойки населения, связанной с пандемией ВИЧ, приведет к появлению новых этиологических агентов заболеваний принадлежащих к роду Mycobacterium. С другой стороны, выявление в мокроте НТМ само по себе далеко не всегда говорит о наличии легочного микобактериоза и может быть обусловлено бессимптомной колонизацией дыхательных путей. Гипотеза проекта предполагает, что видовой состав НТМ, способных вызывать микобактериозы, на азиатских территориях России с высоким уровнем распространения ВИЧ-инфекции (Иркутская
область, Красноярский и Пермский край) может значимо отличаться от описанных на европейской части страны и других регионов мира. Предполагается, что микобактерии выделенные из висцеральных органов, не сообщающихся с окружающей средой (кровь, органы лимфатической системы и т.д.) могут иметь специфические детерминанты вирулентности, повышающие их инвазивность и/или патогенность. Целью проекта является: оценка видового и внутривидового спектра НТМ, выделенных из различных клинических образцов от ВИЧ-инфицированных и других иммуннокомпрометированных больных в европейских и азиатских регионах России; выявление потенциальных генов способствующих повышению инвазивности и/или вирулентности исследуемых клинических штаммов НТМ, выделенных из внутренних органов, не сообщающихся с окружающей средой, оценка спектра антибактериальных препаратов, способных воздействовать на штаммы из ВОНСО; разработка набора ПЦР тестов для ранней специфической индикации микобактериозов и дифференциальной диагностики от возбудителя туберкулеза в клиническом материале.
Публикации и патенты
Найдено
Ничего не найдено, попробуйте изменить настройки фильтра.
Анна Александровна Вязовая, Регина Салаватовна Мударисова, Мария Владимировна Бадлеева, Алена Андреевна Герасимова, Оксана Александровна Пасечник, Ирина Владимировна Костюкова, Наталья Сергеевна Соловьева, Вячеслав Юрьевич Журавлев, Олег Борисович Огарков, Игорь Владиславович Мокроусов
RU2839699C2,
2025
Игорь Владиславович Мокроусов, Светлана Николаевна Жданова, Виолета Вълчева, Галина Ивановна Алексеева, Мария Константиновна Винокурова, Надежда Евстафьевна Евдокимова, Динара Адамжанкызы Найзабаева, Юрий Александрович Скиба, Вячеслав Юрьевич Журавлев, Олег Борисович Огарков
RU2832725C1,
2024
Игорь Владиславович Мокроусов, Анна Александровна Вязовая, Мария Владимировна Бадлеева, Ирина Владимировна Ярусова, Полина Андреевна Хромова, Вячеслав Владимирович Синьков, Светлана Николаевна Жданова, Алена Андреевна Герасимова, Наталья Сергеевна Соловьева, Марина Петровна Татаринцева, Вячеслав Юрьевич Журавлев, Оксана Александровна Пасечник, Олег Борисович Огарков
RU2812351C1,
2024
Анна Александровна Вязовая, Вячеслав Владимирович Синьков, Оксана Александровна Пасечник, Мария Владимировна Бадлеева, Полина Андреевна Хромова, Ирина Владимировна Ярусова, Светлана Николаевна Жданова, Алена Андреевна Герасимова, Наталья Сергеевна Соловьева, Вячеслав Юрьевич Журавлев, Олег Борисович Огарков, Игорь Владиславович Мокроусов
RU2768021C1,
2022
Олег Борисович Огарков, Надежда Павловна Перетолчина, Сергей Игоревич Малов, Елизавета Андреевна Орлова, Лилия Александровна Степаненко, Полина Андреевна Хромова
RU2756203C1,
2021
Партнёры
Адрес лаборатории
Иркутск, ул. Карла Маркса, 3/1
Необходимо авторизоваться.